De officiële naam van de stichting die het museum beheert is: Stichting tot Beheer van het Museum van het Boek / Museum Meermanno-Westreenianum. Deze naam verbindt de twee kerncollecties van het museum en vormt het juridische en inhoudelijke fundament van de instelling.
De publieksnaam — de naam waarmee het museum naar buiten treedt — heeft door de 175-jarige geschiedenis van het museum meerdere variaties gekend. De onderstaande variaties in de naamvoering weerspiegelen de ontwikkeling van het instituut binnen de nationale museumwereld.

Chronologisch overzicht
1848 – Nalatenschap
Baron van Westreenen overlijdt en laat zijn woonhuis en collecties na aan de Staat der Nederlanden. De gestelde voorwaarde is de vestiging van een museum genaamd Museum Meermanno-Westreenianum, een naam die eveneens op de voorgevel dient te staan.
1852 – Rijksmuseum Meermanno-Westreenianum
Het museum opent officieel zijn deuren voor het publiek onder de naam Rijksmuseum Meermanno-Westreenianum.
1960 – Rijksmuseum Meermanno-Westreenianum | Museum van het Boek
De naam wordt uitgebreid met 'Museum van het Boek'. Naast de collectie Meermanno-Westreenianum (ca. 500-1850 beheert het museum vanaf dit jaar ook de internationale collectie Museum van het Boek, (1850-heden) bestaande uit onder meer bibliofiele uitgaven, private-press boeken en kunstenaarsboeken.
2001 – Museum Meermanno
De publieke roepnaam van het museum wordt verkort naar Museum Meermanno.
2005 – Museum Meermanno | Huis van het Boek
De aanduiding 'Huis van het Boek' wordt toegevoegd aan de publieksnaam en het logo.
2010 – Huis van het Boek | Museum Meermanno
De volgorde van de namen in de publieksuitingen wordt omgedraaid.
2012 – Huis van het Boek
Gedurende deze periode wordt 'Huis van het Boek' als primaire publieksnaam gevoerd, mede in het kader van de bestuurlijke samenwerking met de Koninklijke Bibliotheek.
2026 – Rijksmuseum Meermanno
Het museum voert de naam Rijksmuseum Meermanno, in overeenstemming met zijn rol als beheerder van een nationale erfgoedcollectie onder de Erfgoedwet.